Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms