Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms