Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DGG1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DGG1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DGG1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms