Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms