Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM247A6NEH6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms