Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUF60Q9UHX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUF60Q9UHX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUF60Q9UHX1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms