Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A13Q9NSD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A13Q9NSD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC6A13Q9NSD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms