Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CCER1Q8TC90 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCER1Q8TC90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCER1Q8TC90 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms