Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1NQ8N819 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPM1NQ8N819 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms