Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC3Q8IVU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGDCC3Q8IVU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms