Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCD3Q6STE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCD3Q6STE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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