Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL22Q53GT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms