Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM12Q3MHD2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms