Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms