Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX1Q13596 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX1Q13596 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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