Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FusP56959 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FusP56959 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FusP56959 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FusP56959 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FusP56959 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FusP56959 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FusP56959 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FusP56959 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FusP56959 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FusP56959 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FusP56959 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FusP56959 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FusP56959 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FusP56959 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FusP56959 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FusP56959 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FusP56959 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FusP56959 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FusP56959 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FusP56959 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FusP56959 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FusP56959 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FusP56959 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FusP56959 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FusP56959 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FusP56959 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FusP56959 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FusP56959 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FusP56959 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FusP56959 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FusP56959 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FusP56959 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FusP56959 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FusP56959 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FusP56959 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FusP56959 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FusP56959 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FusP56959 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FusP56959 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FusP56959 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FusP56959 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FusP56959 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FusP56959 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FusP56959 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FusP56959 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FusP56959 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FusP56959 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms