Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCP4P48539 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCP4P48539 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCP4P48539 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCP4P48539 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCP4P48539 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCP4P48539 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCP4P48539 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCP4P48539 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCP4P48539 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCP4P48539 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCP4P48539 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCP4P48539 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCP4P48539 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCP4P48539 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCP4P48539 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCP4P48539 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCP4P48539 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCP4P48539 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCP4P48539 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCP4P48539 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms