Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCK1P16333 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCK1P16333 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCK1P16333 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCK1P16333 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCK1P16333 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCK1P16333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCK1P16333 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCK1P16333 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCK1P16333 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCK1P16333 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCK1P16333 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCK1P16333 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCK1P16333 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCK1P16333 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCK1P16333 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCK1P16333 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCK1P16333 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCK1P16333 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCK1P16333 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCK1P16333 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCK1P16333 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCK1P16333 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCK1P16333 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCK1P16333 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCK1P16333 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCK1P16333 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCK1P16333 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCK1P16333 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCK1P16333 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCK1P16333 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCK1P16333 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCK1P16333 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCK1P16333 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCK1P16333 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCK1P16333 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCK1P16333 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCK1P16333 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCK1P16333 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCK1P16333 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCK1P16333 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCK1P16333 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCK1P16333 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCK1P16333 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCK1P16333 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCK1P16333 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCK1P16333 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCK1P16333 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCK1P16333 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCK1P16333 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCK1P16333 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCK1P16333 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCK1P16333 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCK1P16333 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCK1P16333 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCK1P16333 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCK1P16333 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCK1P16333 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCK1P16333 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCK1P16333 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCK1P16333 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms