Protein–RNA interactions for Protein: K7N6T7

Gm2897, Predicted gene 2897, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2897K7N6T7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2897K7N6T7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm2897K7N6T7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2897K7N6T7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm2897K7N6T7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms