Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms