Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNIP3Q9Y2W7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms