Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms