Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MKLN1Q9UL63 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms