Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms