Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms