Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC17Q9NP64 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms