Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms