Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIN3AQ96ST3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms