Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms