Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms