Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms