Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1Q7Z7E8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms