Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms