Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms