Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q5VSD8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms