Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms