Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LACTB2Q53H82 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms