Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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