Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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IRF4Q15306 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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IRF4Q15306 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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IRF4Q15306 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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