Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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