Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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PEX6Q13608 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PEX6Q13608 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PEX6Q13608 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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PEX6Q13608 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PEX6Q13608 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PEX6Q13608 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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