Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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