Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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