Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STRN3Q13033 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms