Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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