Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TWF1Q12792 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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