Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms