Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4DQ08499 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms