Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms