Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01830-201ENST00000450551 636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms